urxvt: unable to create fontset for input method, try "-pt Root". Continuing. urxvt: failed to create input context, continuing without XIM.
"unable to create fontset for input method" というから、-imfont の指定の話かと思っていたのだが、そうではなくて urxvt 自身のほうの "-fn" のところで指定してやれ、ということだったようだ。
フォント回りを調べてみたら、どうやら xfonts-intl-japanese が入ってなかったのが元凶のようだ。shinonome とか ayu とかは自分で入れるんだけど、失念してたな。(どのパッケージも入れろと言ってくれないし)